すっごく根本的なところだと思うんだけど、詰まったのでメモ。
可愛いポーズツール ～３点でもVRChatで可愛い！～
https://yunisaki.booth.pm/items/5479202
アバターポーズライブラリー AvatarPoseLibrary（APL）
https://booth.pm/ja/items/6902222
立ったり座ったり寝転んだりの簡単な動作は可愛いポーズツールが凄く楽なんだけど、ポーズとったり撮影するにあたってはAvatarPoseLibraryを使いたいなって思ったら、AvatarPoseLibraryでポーズとっても一瞬だけポーズしてすぐ直立に戻るっていう沼にハマってしまい。
以下の二通りのやり方で解決しました。
1.ヒエラルキーでAvatarPoseLibraryを一番下にする
基本的にはこれで解消しました。こういったアクションの挙動はヒエラルキーの一番下が優先されるそうなので、可愛いポーズツールよりも下にアバターポーズライブラリーを並び替えるだけで、正しくポーズが表示されるようになりました。
2.MA Merge Animatorで設定する
AvatarPoseLibraryの「Add Component」で、MA Merge Animatorを追加してレイヤー統合優先度を100にするだけ！
統合されるアニメーター：None（そのまま）
レイヤー種別：FX
付属アニメーターを削除：✅ ON（既存のダミーを消してAPLの出力を使う）
パスモード：相対的（デフォルトのまま）
相対的パスのルート：None（デフォルトのまま）
レイヤー統合優先度：100（大きめにして最上位で効かせる）
統合モード：アニメーターに追加
ちょこちょこVCCで修正はいったりアバターの環境によってはエラー出ちゃうので100％これで解決というわけではないですが、ひとまず私の環境では解決できました。
